Orduspor G.Antep'ten transfer yaptı

Galatasaray ile 3 Yıllık Sözleşme İmzaladı 2003-2004 sezonunda İstanbulspor'a geri dönen futbolcu artık takımda da yavaş yavaş kendine yer bulmaya başladı ve o sezon 17 Süper Lig karşılaşmasında forma giydi. Sezon sonunda bir yıl daha sözleşmesi bulunan futbolcu ile masaya oturan İstanbulspor yönetimi Yalçın Ayhan'ın sözleşmesini bir yıl daha uzatırken, futbolcu 2004-2005 sezonunda takımın değişmez ismi oldu ve 32 Süper Lig maçında forma giydi. Bu başarısının ardından büyük takımlarında dikkatini çeken Ayhan, 1 Ağustos 2005 tarihinde Galatasaray ile 3 yıllık sözleşme imzaladı ve sezon başında A2 Milli Takımın Almanya ile yaptığı maçta da görev aldı.