Futbolculuktan teknik direktörlüğe

Boluspor’dan ayrıldıktan sonra İstanbulspor’da görev alan Güneş, efsaneleştiği takım olan Trabzonspor’a bu kez teknik direktör olarak dönüş yapıyordu. 4 sezon bu görevde kaldıktan sonra Antalyaspor’u ve Sakaryaspor’u çalıştırdı. çalıştırdı. Daha sonra Milli Takım’ın başına geçen Şenol Güneş, 2002 Dünya Kupası’nda takımı üçüncü yaparak futbolcuları ile birlikte tarih yazdı